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Nature颠覆性成果遭“中国期刊论文”质疑,病毒究竟有没有CRISPR样系统?

日期:2016-07-12 09:42:56 来源: 生物探索 点击:

\\Virologica Sinica:为什么MIMIVIRE不可能成为适应性免疫系统?

CRISPR-Cas-like system in giant viruses: why MIMIVIRE is not likely to be an adaptive immune system

6月13日,发表在《中国病毒学》(Virologica Sinica)杂志上的这一研究中,法国艾克斯-马赛大学(Aix-Marseille University)的科学家们对Nature上这一研究的观点提出了挑战。

共同通讯作者Jean-Michel Claverie 和Chantal Abergel在论文中写道:MIMIVIRE与CRISPR/Cas系统并不相似,它并不是通过核酸识别系统发挥作用,且不太可能具备真正的适应性免疫系统的所有特性。据The-Scientist网站报道,Didier Raoult与Jean-Michel Claverie过去曾在一起工作,但现在两人的关系很受争议。

此外,这一研究还对巨型病毒(mimivirus)的抵抗机制是否完全是基于核酸提出了质疑。与发表在Nature上的研究观点不同,他们认为,在抵抗性的巨型病毒中,蛋白质可能干扰了virophage的复制。Claverie和Abergel认为,巨型病毒的防御机制丝毫不像CRISPR。

\Protein-based interaction model for Zamiloninhibition.

首先,巨型病毒基因组和virophage的复制发生在相同的位置,这就不可能形成基于核酸的免疫保护。其次,CRISPR代表的是成簇规律间隔的短回文重复(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats),而MIMIVIRE的序列既不是规律间隔的,且两侧也没有可识别的重复序列。第三,对应的Zamilon序列缺乏前间区序列邻近基序(protospacer adjacent motifs,PAMs)。细菌通常是利用PAMs区别病原体DNA和自身DNA。据悉,CRISPR/Cas9系统的靶向特异性部分取决于Cas9蛋白与PAMs的结合。

科学家如何看待这一质疑

对于这些质疑,Raoult说:“MIMIVIRE当然不是CRISPR,这只是个类比。”

一些未参与这项质疑研究的病毒学家也赞同了Claverie 和 Abergel的批评意见。 洛克菲勒大学的Luciano Marraffini表示,尽管MIMIVIRE表面上是一种抗virophage(anti-virophage)系统,但它似乎缺乏CRISPR/Cas系统的一些标志性特征,如重复序列、导向RNA。北卡罗莱纳州立大学的Rodolphe Barrangou对此表示赞同。

此外,研究论坛PubPeer上的一位匿名评论者指出,发表在Nature上的这项研究明显缺少RNA沉默对照组。这就排除了一种可能性,即观察不到virophage感染可能仅仅是因为巨型病毒没有复制。

Virologica Sinica

据《中国病毒学》(Virologica Sinica)官网介绍,该杂志创刊于1986年,2007年出版语种变更为英文,由中国科学院武汉病毒研究所和中国微生物学会共同主办,并自2008年起通过德国施普林格出版社(Springer)进行全球出版发行,被国内外多家重要数据库摘引和收录。

Virologica Sinica是中国生物学医学核心期刊(双月刊,全年6期),期刊栏目包括研究论文、综述、短讯和观点等多种类型,定期反映病毒学及分支领域的最新研究进展,内容涉及新病毒发现、病毒致病机理、病毒-宿主相互作用、疫苗开发、抗病毒药物和疗法、病毒相关生物技术等多个生物医学相关领域。



(责任编辑:xgh)

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